それは、ある夏の日の−いつもと変わらない、なんでもない日のできごとだった。
ヤマトとツバサは、今日も学校の裏山にやって来ていた。ヤマトが見つけたカブトムシ、
ツバサが見つけたモンシロチョウは、いつもと違う昆虫だった。
「聞こえる？ 私たちの声が……」「私たちには、君たちの助けが必要なのだ！」
それは、目の前にいるカブトムシとモンシロチョウの声だった。彼らは『ムシワールド』という異世界から来たといい、カブト、ホワイトと名乗った。カブトとホワイトは『ムシワールド』の危機を救うためのパートナーを探しているという。
『ムシワールド』へと飛んだ二人と二匹を待っていたのは、巨大なムシ型ロボット『ムシボーグ』の襲撃だった。知恵と意志を持った昆虫たちの住む世界『ムシワールド』は、突如として現れた黒い『ムシボーグ』たちによってその平和が乱されようとしていた…。
今、『ムシワールド』を救うため、戦いの旅が幕を開ける…。
